法國(guó)HYDROPTIC公司——ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)
ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)主要用于對(duì)液體中的浮游動(dòng)物樣品進(jìn)行計(jì)數(shù)、大小測(cè)量、種類鑒定以及生物量測(cè)定。
ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)系統(tǒng)是由ZooSCAN、ZooProcess和EcoTaxa網(wǎng)站等共同組成的,ZooSCAN是硬件部分,主要進(jìn)行浮游動(dòng)物樣品掃描,形成數(shù)字圖像。ZooProcess和EcoTaxa是軟件部分,分別以標(biāo)準(zhǔn)化的程序處理原始圖像、對(duì)不同個(gè)體的形態(tài)參數(shù)進(jìn)行自動(dòng)測(cè)量和對(duì)圖像中的浮游動(dòng)物進(jìn)行自動(dòng)分類和計(jì)數(shù)。
ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)工作流程:
1)掃描空白背景;
2)掃描樣品,獲得原始圖片和元數(shù)據(jù)信息;
3)通過(guò)ZooProcess軟件,標(biāo)準(zhǔn)化原始圖片,提取并測(cè)量圖片中不同個(gè)體的形態(tài)參數(shù);
4)通過(guò)對(duì)形態(tài)學(xué)參數(shù)的提取與分析,可進(jìn)一步獲得樣品的粒徑組成、生物學(xué)體積等信息
5)過(guò)EcoTaxa網(wǎng)站已建立的圖像培訓(xùn)數(shù)據(jù)庫(kù),針對(duì)已掃描的樣品圖像進(jìn)行浮游動(dòng)物的自動(dòng)識(shí)別,獲得不同類群浮游動(dòng)物的數(shù)量。
ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)應(yīng)用領(lǐng)域:
生態(tài)學(xué)調(diào)查、漁業(yè)、水產(chǎn)養(yǎng)殖、教育。
ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)原理:
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Microscope 實(shí)驗(yàn)室 | ZooSCAN 實(shí)驗(yàn)室+野外(現(xiàn)場(chǎng)) | UVP 野外(水下原位) |
ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)(CNRS專利)系統(tǒng)使用掃描儀技術(shù),這項(xiàng)技術(shù)帶有傳統(tǒng)照明設(shè)備和一個(gè)用于放置液體的浮游動(dòng)物樣品水密的掃描室。ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)可以記錄高分辨率的數(shù)字化圖像,然后這些數(shù)字化的圖像可以通過(guò)電腦程序進(jìn)行研究。雖然這個(gè)數(shù)字化的浮游動(dòng)物圖像比使用一個(gè)雙目顯微鏡獲得的圖片的分辨率要低,但這項(xiàng)技術(shù)已被證實(shí),在有大型樣品種類時(shí)使用是再適合不過(guò)了。通過(guò)與EcoTaxa網(wǎng)站上已有的浮游動(dòng)物數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行對(duì)照,可以自動(dòng)的識(shí)別、鑒定樣品中浮游動(dòng)物的種類。
浮游動(dòng)物識(shí)別、鑒定網(wǎng)站——EcoTaxa
EcoTaxa網(wǎng)站主界面
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EcoTaxa浮游動(dòng)物分類界面
為什么使用ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)?
傳統(tǒng)分析方法(鏡檢)
◇ 需要專業(yè)人員
◇ 操作過(guò)程相當(dāng)繁瑣
◇ 后期數(shù)據(jù)處理工作量極大
ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)(超高質(zhì)量圖像掃描)
◇ 無(wú)需專業(yè)人員(建庫(kù)之后)
◇ 操作過(guò)程非常簡(jiǎn)單
◇ 后期數(shù)據(jù)由軟件自動(dòng)處理
ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)規(guī)格:
◇ 型號(hào):ZSCA04
◇ 規(guī)格 (LxWxH): 60 x 54 x 36 cm (關(guān)上蓋子)
◇ 質(zhì)量: 25 Kg
◇ 輸入電壓: 110 to 230 VAC, 50 to 60 Hz
◇ 接口: USB 2.0
ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)特性:
◇ 應(yīng)用(專):專門用于浮游動(dòng)物研究
◇ 功能(強(qiáng)):自動(dòng)鑒定、分類、計(jì)數(shù)、計(jì)算生物量
◇ 效率(高):快速批量分析大量浮游動(dòng)物樣品
◇ 信息量(大):經(jīng)緯度、采樣深度、網(wǎng)型、網(wǎng)口面積等
◇ 照明系統(tǒng)(優(yōu)):確保圖像的質(zhì)量和對(duì)比度
◇ 圖像解析度(高):4800dpi
◇ 圖像分辨率(高):14150 x 22640 (3.2億像素,1GB)
ZooSCAN正在進(jìn)行掃描 | 回收Z(yǔ)ooSCAN樣品池中的樣品 |
浮游動(dòng)物樣品池,透明度佳 | ZooSCAN主機(jī)+ZooProcess軟件 |
代表文獻(xiàn):
1.孫 松, 畢永坤, 孫曉霞,2013.基于圖像技術(shù)的膠州灣浮游動(dòng)物優(yōu)勢(shì)種體型參數(shù)與生物量轉(zhuǎn)換關(guān)系研究(RELATIONSHIP BETWEEN SHAPE PARAMETERS AND DRY WEIGHT OF THE DOMINANT ZOOPLANKTON IN JIAOZHOU BAY BASED ON IMAGE METHOD).海洋與湖沼(OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA).44(1):15:22.
2.Pieter Vandromme, Lars Stemmann, Carmen Garcìa-Comas, Léo Berline, Xiaoxia Sun, Gaby Gorsky,2012.Assessing biases in computing size spectra of automatically classified zooplankton from imaging systems: A case study with the ZooScan integrated system.Methods in Oceanography.1–2:3–21.
3.Stéphanie Lelièvre, Elvire Antajan, and Sandrine Vaz,2012.Comparison of traditional microscopy and digitized image analysis to identify and delineate pelagic fish egg spatial distribution.Journal of Plankton Research.34(6):470-483.
4.Jesse R. Powell and Mark D. Ohman,2012.Use of glider-class acoustic Doppler profilers for estimating zooplankton biomass.Journal of Plankton Research.34(6):563-568.
5.Hirche, H., Alfred Wegener Inst. for Polar & Marine Res., Bremerhaven, Germany, Schulz, J., Hanken, T.,2012.A modular imaging system for collection and analysis of live and preserved zooplankton samples.OCEANS, 2012 - Yeosu.(1-4).
6.Lin Ye, Chun-Yi Chang, Chih-hao Hsieh,2011.Bayesian model for semi-automated zooplankton classification with predictive confidence and rapid category aggregation.Marine Ecology Progress Series.441:185-196.
7.孫曉霞, 孫 松, 王世偉, 劉夢(mèng)壇, 趙永芳,2011."圖像自動(dòng)識(shí)別技術(shù)在膠州灣浮游動(dòng)物生態(tài)學(xué)研究中的應(yīng)用(APPLICATION OF AUTOMATED IMAGE IDENTIFICATION IN ZOOPLANKTON
ECOLOGY STUDIES IN THE JIAOZHOU BAY)".海洋與湖沼(OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA).42(5):647:653.
8.Gaby Gorsky, Mark D. Ohman, Marc Picheral, Stéphane Gasparini, Lars Stemmann, Jean-Baptiste Romagnan, Alison Cawood, Stéphane Pesant, Carmen García-Comas and Franck Prejger,2010.Digital zooplankton image analysis using the ZooScan integrated system.Journal of Plankton Research.32(3):285-303.
9.Sabine Schultes, Rubens Lopes,2009.Laser Optical Plankton Counter and Zooscan intercomparison in tropical and subtropical marine ecosystems.Limnology and Oceanography.771-784.
10.LISA R. GILFILLAN, MARK D. OHMAN,2009.OCCURRENCE OF PLASTIC MICRO-DEBRIS IN THE SOUTHERN CALIFORNIA CURRENT SYSTEM.CalCOFI Rep..Vol. 50, 2009.
11.Fabien JOUENNE, Ian PROBERT and Daniel VAULOT,2008.Plankton taxonomy in the computer age.Cah. Biol. Mar..49 : 355-367.
12."G. Gorsky, L. Stemmann, R. Rakotomalala, S. Gasparini, F. Ibanez, E. Antajan, M. Picheral, C. Garcia
Comas",2007.HARMONIZATION OF SAMPLING METHODS AND TREATMENT OF ZOOPLANKTON TIME SERIES.Rapp. Comm. int. Mer Médit., 38, 2007.490.
13.L. Stemmann, J.B. Romagnan, M.G. Mazzocchi, C. Garcia Comas, E. Antajan, M. Picheral, N.J. Daly Yahia, G. Gorsky,2007.ZOOPLANKTON COMMUNITY STRUCTURE AND SIZE DISTRIBUTION IN THE SOUTHERN TYRRHENIAN SEA DURING THE 2005 CIESM SUB 1 AND SUB 2 CRUISES.Rapp. Comm. int. Mer Médit., 38, 2007.606.
14."By Mark C. Benfi eld, Phi l ipp e Gros j ean, Phi l F. Culverhouse , Xabi er Irigoi en,
Michael E . Si eracki , An gel Lopez-Urrutia, Hans G. Dam, Qiao Hu,
Cabel l S . Davis , Al len Hansen, Cynthia H. Pi l skaln, Edward M. Riseman,
H oward Sc hultz, Paul E . Utgoff, and Gabri el Gorsky",2007.RAPID: research on automated plankton identification.Oceanography.20(2):172-187.
15.par Warembourg, C., Grosjean, Philippe, Picheral, M., Ibanez, F., Gorsky, G.,2005.Le ZOOSCAN: un système d’imagerie rapide pour la mesure et la classification automatique du zooplancton.Référence J. Recherche Océanographique, 30, (page 1-12) ..
16.Philippe Grosjean, Marc Picheral, Caroline Warembourg and Gabriel Gorsky,2004.Enumeration, measurement, and identification of net zooplankton samples using the ZOOSCAN digital imaging system.ICES Journal of Marine Science.61(4):518-525.
更多關(guān)鍵詞:浮游動(dòng)物圖像原位采集系統(tǒng),浮游動(dòng)物圖像采集,浮游動(dòng)物自動(dòng)鑒定儀,法國(guó)HYDROPTIC公司,ZooSAN,浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng),水下顆粒物采集系統(tǒng)
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法國(guó)HYDROPTIC公司UVP6-HF水下顆粒物和浮游動(dòng)物圖像原位采集系統(tǒng)介紹.pdf
法國(guó)HYDROPTIC公司UVP6-LP水下顆粒物和浮游動(dòng)物圖像原位采集系統(tǒng)介紹.pdf
法國(guó)HYDROPTIC公司ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng).pdf
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